巴音郭楞地处南疆，既有高山、盆地、戈壁、沙漠，又有平原绿洲、河流湖泊，地形地貌复杂，气候类型、气候状况也按地域略有差别，总体说来，巴州州境处于中温带、暖温带大陆性气候区。
巴州境内山地海拔多在4000米以上，四季相连，无明显差别，干旱少雨，多为荒漠山地；平原地区河流纵横，湖泊众多，四季分明而少有降水，河流湖泊水源补给多靠季节性雪峰融水；而南部沙漠地带日照强烈，紫外线辐射强烈，更是干燥酷热。
巴州州气候干燥，首府库尔勒年均气温在11ºc，夏季7月份最高气温可达40ºc，冬季1月最低气温可达-28ºc，冬寒夏热，不适宜出行；而每年的8、9月份，天气逐渐变得凉爽，此时行游不仅可以一览巴州各地美景，而且此时正值库尔勒香梨上市，定会让您大饱口福。
最佳旅游时间：春、秋两季。